《永乐大典泸州志》 载: “纳溪县，县名。古之有溪，上控永宁界首，下注泸江，昔诸葛武侯平定云南，蛮夷 (少数民族) 纳贡而出此溪，因名纳溪，又曰云溪”。 

纳溪历史悠久。春秋战国时，属巴国巴郡地。汉、晋、南北朝为江阳、汉安、绵水等县地。隋分属泸州、江安、汉安等县地，唐属江安、 泾南县地，北宋仁宗皇祐三年 (１０５１ 年) 在今永宁河入长江的河口置纳溪寨。南宋理宗绍定五年 (１２３２ 年) 升纳溪寨为纳溪县。先属泸州，后属江安州。元、 明、 清三代均属泸州管辖。民国元年 (１９１２年)，属川南军政府，后属下川南道、永宁道。民国十八年 (１９２９ 年) 撤销永宁道，直属四川省政府。民国二十四年(１９３５ 年)，隶属第七区行政督察专员公署。１９４９ 年 １２ 月 ３ 日，纳溪解放， 同月１２日成立纳溪县人民政府，隶属泸县专署。１９５２ 年改属隆昌专署，１９５３年初属泸州专署。１９６０年，改属宜宾专区。１９８３年６月建立省辖泸州市，纳溪县划归泸州市管辖。１９９６年７月１日，纳溪撤县建区，为泸州市纳溪区，结束纳溪建县７６４年历史。